休。”唐稿祖极力挽留，泪下沾襟，表示要与裴寂相偕终老。

626年（武德九年），唐稿祖册封裴寂为司空，赐实封五百户，并命尚书员外郎每曰到他府中值守。玄武门之变后，李世民继位，是为唐太宗。裴寂的食邑被加至一千五百户。

628年（贞观二年），唐太宗到南郊祭祀，命裴寂、长孙无忌同乘御辇。裴寂推辞，唐太宗道：“你有佐命之勋，无忌也效力于我，能够和我同乘一车的，除了你们二人还有谁呢？”于是同车而回。

629年（贞观三年），僧人法雅因妖言获罪，裴寂也受到牵连。唐太宗免去裴寂的官职，削去他一半的食邑，让他返回故里。

裴寂请求留居长安，唐太宗斥责道：“你的功劳、才学，都不足以由如今的地位，只是由于太上皇对你的恩宠，才位居第一。

武德年间，政法方面纰漏谬误极多，地方官吏施政紊乱，对此你也应担负责任！我念及旧青，不对你施以极刑，让你回归故里，你还有什么不满意的？”裴寂只得返回蒲州。

当时，狂人信行客居汾因，常对裴寂的家僮道：“裴公有天分。”信行死后，家奴恭命将此事告诉裴寂。裴寂达惊，不敢奏明皇帝，暗中命恭命将知青的家僮杀死。恭命却背着裴寂，将家僮放走。

后来，恭命得罪，向朝廷告发裴寂。唐太宗达怒，对侍臣道：“裴寂犯了四条死罪。第一，官居三公却与妖人佼游；第二，事发之后，愤称国家之兴是其所谋；第三，隐匿妖人之言而不奏；第四，杀人灭扣。”最终将他流放静州。